智能系统与控制工程系承担着我校“控制科学与工程”一级学科中“控制理论 与控制工程”和“模式识别与智能系统”两个国家重点二级学科建设，受到国家211工程、985工程、国防主干学科、北京市重点学科等建设计划资助。该系源 于建校初期的飞机仪表与自动器专业，并先后融入控制理论教研室、北航第七研究室等单位，曾先后负责“惯性技术及导航设备”、“精密仪器及机械”两个国家重 点学科的建设工作。我国著名的惯性导航与自动控制专家林士谔教授，北航“控制理论与控制工程”学科创立者著名控制专家、中国科学院高为炳院士，以及知名学 者张洪钺教授，先后在不同时期领导了学科与组织建设工作。
目前，全系共有34名教师，其中教授15人（含兼职院士1人）、副教授12人、讲师4人、教辅人员3人；16人为博士生指导教师。现有院士1人，国家级领军人才5人，国家级青年人才9人，并获批“飞行器抗干扰控制理论与应用”教育部创新团队。
智能系统与控制工程系承担本科生与研究生的控制、导航和模式识别与智能系统课程的教学工作，《自动控制原理》于2006、2009年先后被评为国家精品课与国家双语教学示范课，《线性系统理论》2009年被评为“北航研究生优质课程”。教学工作获得国家级教学成果二等奖1项，北京市教学成果一等奖1项，北航教学成果奖9项，获评全国百篇优秀博士论文1篇。
已建立“智能感知与控制一体化技术”北京市国际合作基地、国家卫星导航工程中心组合导航实验室、系统与控制实验室、导航与控制实验室、211建设先进惯性 技术与器件实验室等一批高水平专业实验室。近5年，承担国家973子课题4项、863子课题8项、国家自然科学基金20余项（含重点项目3项、仪器专项1 项）、其它纵向及横向课题80余项，申请发明专利 50 余项，在国内外学术期刊会议发表论文年均170余篇（其中SCI索引年均40余篇），获国家科技进步一等奖1项，国家自然科学二等奖1项，省部级一等奖1 项，省部级二等奖5项。
系主任：张海
书 记:李文玲
研究生副主任：郝飞
本科生副主任：左宗玉
主任助理：李明星
